Il patrimonio archivistico e librario, conservato dall'Archivio Sergio Flamigni, è costituito da una ricca documentazione a stampa e audiovisiva sui temi del terrorismo, delle stragi, della mafia e da una biblioteca specializzata. Il patrimonio documentale comprende l'archivio personale di Sergio Flamigni, i fondi archivistici di Emilia Lotti, Piera Amendola, Giuseppe De Lutiis e un nucleo di libri su Aldo Moro, donati dalla famiglia dello statista; si conservano inoltre gli atti della Commissione parlamentare d'inchiesta sul Caso Moro, della Commissione parlamentare d'inchiesta sulla loggia massonica P2 e della Commissione bicamerale d'inchiesta antimafia delle quali Flamigni è stato reiteratamente membro e le collezioni complete di alcuni quotidiani e periodici. Negli anni 2021-2021 l'Archivio ha acquisito i fondi documentali di Cosmo Barbato, Maurizio Fiasco, Sandro Provvisionato, Vincenzo Vinciguerra, Falco Accame e Giuseppe Stallone.